Obnova samostana, koju su uzrokovala oštećenja nastala srpsko-crnogorskom agresijom 1991., otkrila je ostatke nekoliko različitih freski koje su se nalazile u samostanu, ali su bile prekrivene žbukom.

U veljači 2004. otkriveni su ostaci fresaka iz 14. stoljeća iznad svoda sakristije, u istočnom krilu samostana. Istraživanja, koja su provedena nakon ovog otkrića, pokazala su da su zidovi sakristije bili oslikani freskama i da je ta prostorija imala ravan drveni kasetni strop, koji je također bio oslikan. Ostaci freski su  obnovljeni i ostali su sačuvani, a dijelom se k njima može pristupiti kroz otvore ostavljene u podu iznad njih.

U siječnju 2006. na prvom katu sjevernog krila nađeni su iznad šest ulaznih sobnih vrata ostaci fresaka u medaljonima širine oko 100 cm i visine oko 110 cm. Riječ je o prikazima prvih franjevačkih mučenika, koji su nastali u 18. stoljeću. I ovi oslici su obnovljeni i ponovno krase nadvratnike fratarskih soba.

Dok su oslici iznad svoda sakristije i na prvom katu sjevernog krila samostana otkriveni prilikom obnove, oslik u prizemlju sjevernog krila samostana otkriven je, sasvim slučajno, prilikom bojadisanja zida, u lipnju 2006. Riječ je freski koja je nastala u 14. stoljeću, a prikazuje Bogorodicu, izvedenicu ikonografskog tipa Hodegitrije (ona koja pokazuje put). Bogorodica lijevom rukom pridržava dijete Isusa. Lijevo od prijestolja na kojem sjedi Bogorodica u stojećem stavu nalazi se Arhanđeo Gabrijel s Kristovim monogramom u desnoj ruci. Pored njegove aureole nalazi se monogram (AGA GABIA), koji potvrđuje o kojem je  anđelu  riječ.